専攻科・海洋技術科には航海コースと機関コースがあり、船長や機関長などの船舶の幹部職員の養成を目指します。2年間の課程で1年間の翔洋丸乗船実習と、三級海技士以上の免許取得のための学習を行います。修了後には、水産・海洋系大学と同じように、三級海技士の受験に必要な乗船履歴が得られます。また、一般商船でのインターンシップも行います。
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